实验室检测如何揭开食物中毒暴发之谜
生病晚宴之谜
你刚刚举办了一场看似完美的晚宴。朋友们聚在一起,房间里充满欢声笑语,而食物——也许是烤鸡沙拉或自制意面——成了主角。但黎明时分,几位客人却从浴室地板上发信息给你,说他们感到恶心、痉挛和腹泻。你的第一反应是责怪鸡肉。也许没有煮熟?或者蛋黄酱放太久了?
但万一这不仅仅是运气不好呢?万一你的晚宴实际上是一个更大谜题的一小部分——一场全国性的疫情,而全国各地的实验室科学家已经在使用高科技工具来追查真正的罪魁祸首呢?这就是食物中毒暴发的隐藏现实——它始于显微镜和一份粪便样本。
了解疫情调查为何影响你
食物中毒是大多数人认为自己永远不需要考虑的事情。你在新闻中听到召回,也许扔掉一些生菜,然后继续生活。但这里有个值得了解的原因:食源性疾病非常常见。美国疾病控制与预防中心(CDC)估计,每年有六分之一的美国人因受污染的食物而生病。这将近5000万人。
每次重大召回或疫情警报的背后,都有一组调查人员使用实验室测试来寻找源头。你如何应对召回、向医生报告什么、甚至你对上一餐的看法,都会受到你对系统运作方式了解程度的影响。此外,这也是一个窥探迷人世界的机会,在这个世界里,微小的细菌留下遗传线索,而这些线索可以像指纹一样被解读,以解开一个大规模的谜题。
什么是食物中毒暴发?我们如何知道它是暴发?
在公共卫生术语中,暴发是指两个或更多人因食用相同的受污染食物或饮品而生病。但当局如何知道它正在发生?通常,它始于一个简单的电话。一个人因严重的肠胃问题去看医生。医生将粪便样本送到实验室。如果发现了沙门氏菌或大肠杆菌或其他病原体,实验室会报告给当地卫生部门。然后同一城市出现另一个病例。接着又一个。
这些报告被汇总到一个名为PulseNet的国家数据库中,由CDC运行。可以把它想象成一个全国性的细菌“头号通缉”名单。当卫生官员看到几个人感染了看起来非常相似的相同菌株时,他们知道出事了。但要确认这是暴发——并找到罪魁祸首——他们需要拿出实验室的重型武器。
食物中毒暴发的公共卫生定义是什么?
从粪便样本到DNA指纹:实验室检测过程
这就是侦探工作既令人恶心又美妙的地方。
首先,调查人员收集样本。最常见的是来自病人的粪便样本,但有时也指可疑餐食的剩菜。所有这些都会被送到公共卫生实验室。
在那里,科学家们试图培养细菌。他们将少量样本涂抹在充满细菌喜欢胶状物质的培养皿上。如果有东西生长,他们就会用特定光线照射或添加化学物质来确定它是什么。是沙门氏菌吗?是大肠杆菌吗?这一步通常需要一两天。
但仅仅知道细菌类型是不够的,因为沙门氏菌有许多菌株。这就像知道肇事逃逸的汽车是一辆白色轿车——有帮助,但不足以找到正确的车。
因此,科学家们更深入。几十年来,他们使用一种称为脉冲场凝胶电泳(PFGE)的技术。它涉及用特殊酶切碎细菌的DNA,然后将碎片放在凝胶上并通以电流。不同大小的片段以不同速度移动,形成条带图案。它看起来很像条形码。如果两个病人有相同的“条形码”,这强烈表明他们来自同一感染源。
如今,随着全基因组测序(WGS)的出现,游戏规则发生了更大变化。WGS不只是读取条形码,而是读取细菌的整个遗传密码。这就像逐字比较同一本书的两个副本,而不仅仅是看封面。有了这项技术,科学家不仅能判断两个样本是否相关,还能精确了解它们如何相关,甚至可以将细菌追溯到特定的农场或加工厂。
这个过程并不即时。简单测试可能需要一两天;全测序可能需要一周或更长时间。但是,当调查人员发现病人体内的细菌DNA与一包生菜或一罐花生酱中的细菌完全匹配时,案件基本上就解决了。
在追踪细菌感染方面,全基因组测序(WGS)相比脉冲场凝胶电泳(PFGE)的主要优势是什么?
实验室检测解决的真实疫情
你可能从新闻中记得其中一些疫情,但在所有事件中,实验室检测都是无名英雄。
2018年与罗马生菜相关的大肠杆菌O157:H7疫情:美国近100人患病。调查人员从患者身上采集样本,利用全基因组测序发现,每个病例中的细菌DNA完全相同。这使他们能够将生菜追溯到亚利桑那州尤马的一个农场。如果没有测序,他们可能永远无法缩小范围。
2009年花生酱中的沙门氏菌疫情:46个州超过700人受到感染。通过测试特定制造商未开封的花生酱罐,CDC发现了与患者感染的完全相同的沙门氏菌株。这导致了历史上最大规模的食品召回之一,并改变了花生酱的加工方式。
2015年与蓝铃冰淇淋相关的李斯特菌疫情:十人因李斯特菌病住院,数人死亡与同一菌株有关。实验室检测在工厂的冰淇淋样本中发现了李斯特菌,并在基因上与患者匹配。该公司停止生产,召回了数百万产品,并全面改革了安全规程。
在每一起案例中,实验室检测将零散的“肚子不舒服”报告变成了确凿的污染证据。
在2018年大肠杆菌疫情中,实验室检测如何将食源性疾病病例与共同来源明确联系起来?
人们对食物中毒调查常有的误解
即使听过这样的故事,仍有一些持续的误解会让人困惑。
首先,许多人认为他们最后一餐总是导致症状的原因。但食物中毒通常有潜伏期。沙门氏菌的症状可能在进食后6到72小时出现。一些病原体,如李斯特菌,可能需要数周才会引起疾病。所以你昨天吃的鸡肉晚餐可能不是罪魁祸首——可能是两天前吃的东西。
其次,实验室测试并非即时。你不可能提供样本后一小时内得到结果。培养细菌需要时间。完整的DNA测序需要更长时间。对于大疫情,结果可能需要数周才能陆续得出。公共卫生实验室还需要对病例进行优先级排序,因此有些人的样本从未得到全面分析。
第三,阴性检测结果并不意味着食物是安全的。如果一份剩意面的样本对沙门氏菌呈阴性,可能只是污染分布不均,或者细菌未能在样本中存活。阴性测试绝不是绝对的“一切安全”。
最后,许多人认为所有疫情都能迅速被发现和控制。实际上,小规模疫情被忽视。许多人因轻微的肠胃不适不去看医生,因此他们的疾病从未被报告。调查人员通常只知道较大的集群。
为什么你吃的最后一餐可能不是食物中毒症状的原因?